自分が解いたわけじゃないですが
終わりと始まりが重なる、の説明があんまり外で見かけなかったので
６つ密室があることで発生する心理的死角がこのトリックではないかと、
で、単純化して３つの密室Ａ，Ｂ，Ｃとした場合に
Ａで人物Ａを殺し、部屋Ｃの偽の鍵Ｃ’を置いて鍵Ａをかける
Ｂで人物Ｂを殺し、部屋Ａの鍵を置いて鍵Ｂをかける
Ｃで人物Ｃを殺し、部屋Ｂの鍵を置いて鍵Ｃをかけ、鍵Ｃを隠し持つ
これで状況は完了、犯人は部屋Ｃ以外を入り辛い場所にしておく
（Ｃを１階窓あり客間、Ｂを２階部屋、Ａを離れの礼拝堂）
で、館を捜索し始めて最初に部屋Ｃの窓を割って入り、鍵Ｂを拾う
鍵Ｂを用いて部屋Ｂを開け、鍵Ａを拾う、最後に鍵Ａを用いて部屋Ａを開け、偽の鍵Ｃ’を拾う
そしてＣの部屋に戻るが最初に窓割って入ってドアから出ている為、鍵Ｃ’を使わずに入れる
つまり使わないので偽物の鍵でも気づかない
あとは折を見て鍵Ｃと偽鍵Ｃ’をすり替えれば証拠が消える
と言うトリックかと、３つだと最後の鍵使ってなくね？と気づくかもしれないが
６つもあるとまたか、またか、となって最後まで同じだと思い込む可能性が高い
また、合鍵はない、との赤字も偽の鍵までは禁じてないのでセーフかと
この場合部屋Ｃに窓割って入ろうと言い出した留弗夫が怪しくて
アニメでは窓の外から客間Ｃの死体紗音が見えていて、秀吉が不審に思って割って入っている
最後の密室と最初の密室が重なっていて最初の密室チェックを忘れる、というのが
終わりと始まりが重なる、の説明かな？とか